本研究提出了一种创新的基于YOLOV8深度学习模型的医学影像肺结节检测与诊断系统,旨在为肺结节的早期检测与诊断提供智能化支持。

项目信息

编号:PDV-18
大小:108M

运行条件

Python开发环境:
– PyCharm的安装包:PyCharm: Python IDE for Professional Developers
– PyCharm的历史安装包:PyCharm: Python IDE for Professional Developers
– Anaconda的安装包:Anaconda | Start Coding Immediately
– Python开发版本:Python==3.9

需要安装依赖包:
– pip install PyQt5== 5.15.11
– pip install Pillow==9.5.0
– pip install opencv-python==4.10.0.84
– pip install torch==2.4.0
– pip install torchvision==0.19.0
– pip install numpy== 1.26.4
– pip install matplotlib==3.9.2

项目介绍

本研究提出了一种创新的基于YOLOV8深度学习模型的医学影像肺结节检测与诊断系统,旨在为肺结节的早期检测与诊断提供智能化支持。肺结节作为肺癌早期病变的常见表现,其准确检测和诊断对提高早期肺癌的治疗效果至关重要。然而,传统的肺结节检测依赖于医生的经验和手工标注,存在较大的主观性和工作量。因此,如何借助人工智能技术实现快速、精准的自动化检测成为亟待解决的问题。

该系统通过结合最新的YOLOV8深度学习模型,利用其高效的目标检测能力,对医学影像中的肺结节进行精准的检测和分类。同时,系统还集成了PyQt5图形用户界面,为用户提供了友好、直观的操作体验。通过该界面,用户可以方便地导入CT影像数据,进行检测操作,并实时查看检测结果及相关诊断建议。系统还提供了对检测结果的可视化功能,使医生能够直观地了解肺结节的位置、大小和类型,从而辅助诊断决策。

数据集方面,系统选用了多种真实的肺结节CT影像,经过严格的预处理步骤后,这些数据用于训练和验证YOLOV8模型。预处理过程包括图像增强、噪声过滤和数据扩充,确保模型在训练过程中能够学习到肺结节的多种特征,提高检测的泛化能力和准确性。系统不仅可以对肺结节进行检测和定位,还能够对不同类型的肺结节进行分类,提供详细的诊断信息。这为医生提供了参考依据,有助于减少误诊和漏诊。

实验结果表明,该系统在肺结节检测任务中具有较高的精度和召回率,能够有效减少假阳性和假阴性的发生。与传统的检测方法相比,系统在检测速度和精度上都具有明显的优势,为医学影像智能分析提供了切实可行的解决方案。该系统不仅能够减轻医生的工作负担,还可以通过其高效性和可靠性为医疗诊断提供有力的技术支持。

本系统为肺结节的智能化检测与诊断提供了一种先进的工具,展示了深度学习技术在医学影像分析领域的广阔应用前景。未来的研究可以进一步扩展系统的功能,如引入多模态数据分析以及跨设备的影像检测,以提高其在不同临床场景下的适用性和鲁棒性

项目文档

Tipps:可以根据您的需求进行写作,确保文档原创!
– 项目文档:写作流程

算法流程

代码讲解

Tipps:仅对train.py部分代码简要讲解。该项目可以按需有偿讲解,提供后续答疑。

项目数据

Tipps:通过搜集关于数据集为各种各样的肺结节相关图像,并使用Labelimg标注工具对每张图片进行标注,分1个检测类别,分别是Nodule表示”肺结节”。

目标检测标注工具
(1)labelimg:开源的图像标注工具,标签可用于分类和目标检测,它是用python写的,并使用Qt作为其图形界面,简单好用(虽然是英文版的)。其注释以 PASCAL VOC格式保存为XML文件,这是ImageNet使用的格式。此外,它还支持 COCO数据集格式。
(2)安装labelimg 在cmd输入以下命令 pip install labelimg -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple

结束后,在cmd中输入labelimg

初识labelimg

打开后,我们自己设置一下

在View中勾选Auto Save mode

接下来我们打开需要标注的图片文件夹

并设置标注文件保存的目录(上图中的Change Save Dir)
接下来就开始标注,画框,标记目标的label,然后d切换到下一张继续标注,不断重复重复。

Labelimg的快捷键

(3)数据准备
这里建议新建一个名为data的文件夹(这个是约定俗成,不这么做也行),里面创建一个名为images的文件夹存放我们需要打标签的图片文件;再创建一个名为labels存放标注的标签文件;最后创建一个名为 classes.txt 的txt文件来存放所要标注的类别名称。

data的目录结构如下:
│─img_data
│─images 存放需要打标签的图片文件
│─labels 存放标注的标签文件
└ classes.txt 定义自己要标注的所有类别(这个文件可有可无,但是在我们定义类别比较多的时候,最好有这个创建一个这样的txt文件来存放类别)

首先在images这个文件夹放置待标注的图片,这里是一类图片,就是using phone。
生成文件如下:

“classes.txt”定义了你的 YOLO 标签所引用的类名列表。

(4)YOLO模式创建标签的样式

存放标签信息的文件的文件名为与图片名相同,内容由N行5列数据组成。
每一行代表标注的一个目标,通常包括五个数据,从左到右依次为:类别id、x_center、y_center、width、height。
其中:
–x类别id代表标注目标的类别;
–x_center和y_center代表标注框的相对中心坐标;
–xwidth和height代表标注框的相对宽和高。

注意:这里的中心点坐标、宽和高都是相对数据!!!

存放标签类别的文件的文件名为classes.txt (固定不变),用于存放创建的标签类别。

完成后可进行后续的yolo训练方面的操作。

模型训练

Tipps:模型的训练、评估与推理

1.YOLOv8的基本原理

YOLOv8是一个SOTA模型,它建立在Yolo系列历史版本的基础上,并引入了新的功能和改进点,以进一步提升性能和灵活性,使其成为实现目标检测、图像分割、姿态估计等任务的最佳选择。其具体创新点包括一个新的骨干网络、一个新的Ancher-Free检测头和一个新的损失函数,可在CPU到GPU的多种硬件平台上运行。

YOLOv8是Yolo系列模型的最新王者,各种指标全面超越现有对象检测与实例分割模型,借鉴了Yolov5、Yolov6、YoloX等模型的设计优点,在全面提升改进Yolov5模型结构的基础上实现,同时保持了Yolov5工程化简洁易用的优势。

Yolov8模型网络结构图如下图所示:

2.数据集准备与训练

本研究使用了包含各种肺结节相关图像的数据集,并通过Labelimg标注工具对每张图像中的目标边框(Bounding Box)及其类别进行标注。然后主要基于YOLOv8n这种模型进行模型的训练,训练完成后对模型在验证集上的表现进行全面的性能评估及对比分析。模型训练和评估流程基本一致,包括:数据集准备、模型训练、模型评估。本次标注的目标类别为肺结节,数据集中共计包含1186张图像,其中训练集占938张,验证集占248张。部分图像如下图所示:

部分标注如下图所示:

图片数据的存放格式如下,在项目目录中新建datasets目录,同时将检测的图片分为训练集与验证集放入datasets目录下。

接着需要新建一个data.yaml文件,用于存储训练数据的路径及模型需要进行检测的类别。YOLOv8在进行模型训练时,会读取该文件的信息,用于进行模型的训练与验证。
data.yaml的具体内容如下:

train: E:\PulmonaryNodulesDetection_v8\datasets\images\train 训练集的路径
val: E:\PulmonaryNodulesDetection_v8\datasets\images\val 验证集的路径

nc: 1 模型检测的类别数,共有1个类别。
names: [‘nodule’]

这个文件定义了用于模型训练和验证的数据集路径,以及模型将要检测的目标类别。

数据准备完成后,通过调用train.py文件进行模型训练,epochs参数用于调整训练的轮数,batch参数用于调整训练的批次大小(根据内存大小调整,最小为1)。

CPU/GPU训练代码如下:

加载名为 yolov8n.pt 的预训练YOLOv8模型,yolov8n.pt是预先训练好的模型文件。
使用YOLO模型进行训练,主要参数说明如下:
(1)data=data_yaml_path: 指定了用于训练的数据集配置文件。
(2)epochs=150: 设定训练的轮数为150轮。
(3)batch=4: 指定了每个批次的样本数量为4。
(4)optimizer=’SGD’):SGD 优化器。
(7)name=’train_v8′: 指定了此次训练的命名标签,用于区分不同的训练实验。

3.训练结果评估

在深度学习的过程中,我们通常通过观察损失函数下降的曲线来了解模型的训练情况。对于YOLOv8模型的训练,主要涉及三类损失:定位损失(box_loss)、分类损失(cls_loss)以及动态特征损失(dfl_loss)。训练完成后,相关的训练过程和结果文件会保存在 runs/ 目录下,具体如下:

各损失函数作用说明:
定位损失box_loss:预测框与标定框之间的误差(GIoU),越小定位得越准;
分类损失cls_loss:计算锚框与对应的标定分类是否正确,越小分类得越准;
动态特征损失(dfl_loss):DFLLoss是一种用于回归预测框与目标框之间距离的损失函数。在计算损失时,目标框需要缩放到特征图尺度,即除以相应的stride,并与预测的边界框计算Ciou Loss,同时与预测的anchors中心点到各边的距离计算回归DFLLoss。这个过程是YOLOv8训练流程中的一部分,通过计算DFLLoss可以更准确地调整预测框的位置,提高目标检测的准确性。

训练结果如下:

这张图展示了YOLOv8模型在训练和验证过程中的多个重要指标的变化趋势,具体如下:

train/box_loss:
(1)分类损失,反映模型在识别物体类别时的误差。
(2)损失值显著下降,表明模型在分类任务上的精度正在提高。

train/cls_loss:
(1)训练过程中类别分类损失(Classification Loss)的变化,表明模型在预测物体类别时的误差。
(2)随着训练的进行,损失逐渐减少,模型在分类任务上变得更加准确。

train/dfl_loss:
(1)分布焦点损失 (DFL),处理边界框和真实值之间的差异。
(2)该值逐步降低,意味着模型在处理边界框预测时表现更好。

metrics/precision(B):
(1)精确率,表示模型正确检测出的目标占所有检测出的目标的比例。
(2)随着迭代次数增加,精确率逐渐上升,表明模型对检测目标的预测更精确。

metrics/recall(B):
(1)召回率,表示模型检测出的真实目标占所有实际存在目标的比例。
(2)曲线显示召回率稳步上升,说明模型能够识别出更多的目标。

val/box_loss:
(1)验证集上边界框回归损失的变化。
(2)表示模型在验证集上预测边界框时的误差。

val/cls_loss:
(1)验证集上的分类损失,逐步减少。
(2)说明模型在验证集上的分类性能有所提升。

val/dfl_loss:
(1)验证集上的分布焦点损失。
(2)下降趋势表明模型在验证集上处理边界框与真实标签的差异时表现更加优异。

metrics/mAP50(B):
(1)在IoU阈值为0.5时的平均精度。
(2)随着训练的进行不断提高,表明模型整体检测精度提升。

metrics/mAP50-95(B):
(1)不同IoU阈值下的平均精度。
(2)随着训练的深入不断上升,说明模型在多个阈值下的检测性能都在改进。

这些图显示了YOLOV8模型在训练和验证过程中各项指标的变化趋势。随着迭代次数的增加,训练和验证的损失逐渐下降,精度和召回率持续上升,表明模型的性能在逐步提升,并在多个指标上表现出稳定的优化。

用于评估分类模型的性能,特别是在不平衡数据集上,PR曲线是评价检测任务的重要工具。该图展示了不同类别在不同阈值下的精确率和召回率的关系,能够反映模型在不同类别上的检测效果。以下是详细解释:

Precision(精确率):
(1)精确率,表示模型预测出的肺结节中,实际是肺结节的比例。
(2)精确率越高,意味着模型的预测准确性更好。

Recall(召回率):
(1)召回率,表示检测出的实际肺结节占所有肺结节的比例。
(2)数值越高,说明模型能检测出更多的肺结节。

不同颜色的曲线:代表不同类别的PR曲线。
(1)Ballooning(蓝色): 曲线的面积最大,精确率和召回率整体较高,mAP(平均精度)为0.807,说明该类别的检测效果最好。
(2)Steatosis(红色): mAP为0.739,表现也相对较好,精确率和召回率在大多数情况下都维持较高水平。
(3)Fibrosis(橙色): mAP为0.410,精确率和召回率相对较低,说明模型在该类别上的检测效果较弱。
(4)Inflammation(绿色): mAP为0.390,是所有类别中表现最弱的类别,精确率和召回率都较低,表明模型在该类别上的识别有很大提升空间。

曲线分析:
(1)从图中可以看到,随着召回率的提高,精确率逐渐下降,这是典型的PR曲线趋势。
(2)高精确率意味着少误检,高召回率意味着更多的真实肺结节被检测到。
(3)总体来说,PR曲线的平滑度和斜率反映了模型的检测性能。

在于展示模型在肺结节检测任务中的性能,并通过PR曲线帮助研究者或开发者分析模型在不同阈值下的精确率与召回率的权衡。

4.检测结果识别

模型训练完成后,我们可以得到一个最佳的训练结果模型best.pt文件,在runs/train/weights目录下。我们可以使用该文件进行后续的推理检测。
imgTest.py 图片检测代码如下:

加载所需库:
(1)from ultralytics import YOLO:导入YOLO模型类,用于进行目标检测。
(2)import cv2:导入OpenCV库,用于图像处理和显示。

加载模型路径和图片路径:
(1)path = ‘models/best.pt’:指定预训练模型的路径,这个模型将用于目标检测任务。
(2)img_path = “TestFiles/0229.png”:指定需要进行检测的图片文件的路径。

加载预训练模型:
(1)model = YOLO(path, task=’detect’):使用指定路径加载YOLO模型,并指定检测任务为目标检测 (detect)。
(2)通过 conf 参数设置目标检测的置信度阈值,通过 iou 参数设置非极大值抑制(NMS)的交并比(IoU)阈值。

检测图片:
(1)results = model(img_path):对指定的图片执行目标检测,results 包含检测结果。

显示检测结果:
(1)res = results[0].plot():将检测到的结果绘制在图片上。
(2)cv2.imshow(“YOLOv8 Detection”, res):使用OpenCV显示检测后的图片,窗口标题为“YOLOv8 Detection”。
(3)cv2.waitKey(0):等待用户按键关闭显示窗口

此代码的功能是加载一个预训练的YOLOv8模型,对指定的图片进行目标检测,并将检测结果显示出来。

执行imgTest.py代码后,会将执行的结果直接标注在图片上,结果如下:

这段输出是基于YOLOv8模型对图片“image.jpg”进行检测的结果,具体内容如下:

图像信息:
(1)处理的图像路径为:E:\PulmonaryNodulesDetection_v8\TestFiles\0229.png。
(2)图像尺寸为 640×640 像素。

检测结果:
(1)模型检测到 1个结节 (nodule)。
(2)每张图片的推理时间为9.2毫秒。

处理速度:
(1)预处理时间:5.283 毫秒
(2)推理时间:9.213 毫秒
(3)后处理时间:99.137 毫秒

检测类别:
YOLOv8模型检测的1类病变:
(1)1 个结节 (nodule)

此YOLOv8模型检测出了图像中的1个结节,整个处理流程包括预处理、推理和后处理,总体运行速度较快,结果被保存到指定的文件夹。

运行效果

– 运行 MainProgram.py

1.主要功能:
(1)可用于实时检测肺结节图片中的肝病类型;
(2)支持图片、视频及摄像头进行检测,同时支持图片的批量检测;
(3)界面可实时显示目标位置、目标总数、置信度、用时等信息;
(4)支持图片或者视频的检测结果保存。

2.检测结果说明:

这张图表显示了基于YOLOv8模型的目标检测系统的检测结果界面。以下是各个字段的含义解释:

用时(Time taken):
(1)这表示模型完成检测所用的时间为0.025秒。
(2)这显示了模型的实时性,检测速度非常快。

目标数目(Number of objects detected):
(1)检测到的目标数目为1,表示这是当前检测到的第1个目标。

目标选择(下拉菜单):全部:
(1)这里有一个下拉菜单,用户可以选择要查看的目标类型。
(2)在当前情况下,选择的是“全部”,意味着显示所有检测到的目标信息。

类型(Type):
(1)当前选中的行为类型为 “肺结节”,表示系统正在高亮显示检测到的“nodule”行为。

置信度(Confidence):
(1)这表示模型对检测到的目标属于“肺结节”类别的置信度为92.74%。
(2)置信度反映了模型的信心,置信度越高,模型对这个检测结果越有信心。

目标位置(Object location):
(1)xmin: 100, ymin: 131:目标的左上角的坐标(xmin, ymin),表示目标区域在图像中的位置。
(2)xmax: 120, ymax: 151:目标的右下角的坐标(xmax, ymax),表示目标区域的边界。

这些坐标表示在图像中的目标区域范围,框定了检测到的“肺结节”的位置。

这张图展示了肺结节检测系统的一次检测结果,包括检测时间、检测到的种类、各行为的置信度、目标的位置信息等。用户可以通过界面查看并分析检测结果,提升医学影像诊断的效率。

3.图片检测说明

点击打开图片按钮,选择需要检测的图片,或者点击打开文件夹按钮,选择需要批量检测图片所在的文件夹。
操作演示如下:
(1)点击目标下拉框后,可以选定指定目标的结果信息进行显示。
(2)点击保存按钮,会对检测结果进行保存,存储路径为:save_data目录下。

检测结果:系统识别出图片中的肺结节,并显示检测结果,包括总目标数、用时、目标类型、置信度、以及目标的位置坐标信息。

4.视频检测说明

点击视频按钮,打开选择需要检测的视频,就会自动显示检测结果,再次点击可以关闭视频。
点击保存按钮,会对视频检测结果进行保存,存储路径为:save_data目录下。

检测结果:系统对视频进行实时分析,检测到肺结节并显示检测结果。表格显示了视频中多个检测结果的置信度和位置信息。

这个界面展示了系统对视频帧中的多目标检测能力,能够准确识别肺结节,并提供详细的检测结果和置信度评分。

5.摄像头检测说明

点击打开摄像头按钮,可以打开摄像头,可以实时进行检测,再次点击,可关闭摄像头。

检测结果:系统连接摄像头进行实时分析,检测到肺结节并显示检测结果。实时显示摄像头画面,并将检测到的行为位置标注在图像上,表格下方记录了每一帧中检测结果的详细信息。

6.保存图片与视频检测说明

点击保存按钮后,会将当前选择的图片(含批量图片)或者视频的检测结果进行保存。
检测的图片与视频结果会存储在save_data目录下。
保存的检测结果文件如下:

图片文件保存的csv文件内容如下,包括图片路径、目标在图片中的编号、目标类别、置信度、目标坐标位置。
注:其中坐标位置是代表检测框的左上角与右下角两个点的x、y坐标。

(1)图片保存

(2)视频保存

– 运行 train.py
1.训练参数设置

(1)data=data_yaml_path: 使用data.yaml中定义的数据集。
(2)epochs=150: 训练的轮数设置为150轮。
(3)batch=4: 每个批次的图像数量为4(批次大小)。
(4)name=’train_v8′: 训练结果将保存到以train_v8为名字的目录中。
(5)optimizer=’SGD’: 使用随机梯度下降法(SGD)作为优化器。

虽然在大多数深度学习任务中,GPU通常会提供更快的训练速度。
但在某些情况下,可能由于硬件限制或其他原因,用户需要在CPU上进行训练。

温馨提示:在CPU上训练深度学习模型通常会比在GPU上慢得多,尤其是像YOLOv8这样的计算密集型模型。除非特定需要,通常建议在GPU上进行训练以节省时间。

2.训练日志结果

这张图展示了使用YOLOv8进行模型训练的详细过程和结果。

训练总时长:
(1)模型在训练了150轮后,总共耗时0.687小时。

性能指标:
(1)mAP50: 0.721:在IoU阈值为0.5时的平均精度为72.1%。
(2)mAP50-95: 0.317:在不同IoU阈值(从0.5到0.95)下的平均精度为31.7%。

速度:
(1)0.2ms preprocess: 每张图像的预处理时间为0.2毫秒。
(2)1.4ms inference: 每张图像的推理时间为1.4毫秒。
(3)0.0ms loss: 计算损失的时间为0.0毫秒。
(4)0.8ms postprocess: 每张图像的后处理时间为0.8毫秒(如绘制边界框等)。

结果保存:
(1)Results saved to runs\detect\train_v8:验证结果保存在 runs\detect\train_v8 目录下。

完成信息:
(1)Process finished with exit code 0:表示整个验证过程顺利完成,没有报错。

该模型在验证阶段表现出良好的精确率和召回率,mAP50达到72.1%,表明模型在较宽松的IoU阈值下有较高的检测准确性。在更严格的mAP50-95标准下,平均精度为31.7%,表明在各种IoU阈值下,模型的整体性能表现仍然较好。

远程部署

Tipps:购买后可有偿协助安装,确保运行成功。
– 远程工具:Todesk向日葵远程控制软件
– 操作系统:Windows OS
– 客服QQ:3666308803

项目文件

文件目录

Tipps:完整项目文件清单如下:
项目目录
– 1.Code (完整代码:确保运行成功)
– 2.Result (运行结果:真实运行截图)
– 3.Demo (演示视频:真实运行录制)

声明:本站所有项目资源都可以正常运行,亲测无错!而且我们录制了演示视频,在我们注明的环境版本下,项目运行效果完全和演示视频一致。客服QQ:下载须知